核酸抽出装置とは？検体からDNA・RNAを取り出す装置の種類（磁性粒子法・メンブレン法・遠心型）と、同時処理数・処理時間・価格の選び方

この記事の答え

核酸抽出装置は、血液や組織などの検体からDNAやRNAを自動で取り出す装置です。核酸の分け方で、磁性粒子法・メンブレン法・遠心型に分かれます。選ぶときは「取りたい核酸と検体」「1回の検体数」「試薬の費用」の3つを先に決めます。

核酸抽出装置とは

核酸抽出装置は、血液や組織、培養細胞などの検体からDNAやRNAを自動で取り出す装置です。核酸自動分離装置、自動核酸精製装置とも呼びます。取り出した核酸は、PCRやシーケンサーの検査に回します。

比較ページには、自社ブランドの装置を日本語の公式ページで案内している会社の製品を、型番の単位で載せています。増やすサーマルサイクラー、キットや磁性ビーズだけの製品は別の品として除いています。

3つの種類

磁性粒子法は、核酸を磁性粒子に付けて、磁石で粒子ごと動かして洗い、溶かし出します。magLEAD、Maxwell、KingFisherがこの型です。
メンブレン法は、薄い膜に液を通して核酸を吸着させます。クラボウのQuickGene-Auto12SIIは弱い圧力で液を通す加圧フィルター方式で、遠心の工程がありません。
遠心型は、試薬を足して攪拌し、遠心で分ける工程を機械が進めます。クラボウのGENE PREP STAR PI-480αがこの型で、プラスミドや組織のDNAを扱います。

選ぶときの3つ

取りたい核酸と検体

機種ごとに、用意された手順と試薬が違います。血液からDNAを取るのか、FFPEからRNAを取るのか、プラスミドを取るのかを先に決めて、公式の手順にあるかを確かめます。

QuickGene-Auto12SIIの手順には、血液DNA、組織DNA、FFPE DNA、組織RNA、microRNAなどがあります。
GENE PREP STAR PI-480αの手順には、プラスミド、動物組織DNA、植物組織DNAがあります。
マグナピュア 24 インスツルメントは、1種類の共通試薬で10種類のヒト検体を扱えます。

1回の検体数

毎日流す数に合わせます。小さい機種を何度も回すのと、大きい機種を1回回すのとでは、手間も置き場所も変わります。

magLEAD 4gCは、1バッチ1〜4検体です。
Maxwell RSCは最大16サンプル、Maxwell RSC 48は最大48サンプルです。
KingFisher Flexは、1回に24または96サンプルです。
GENE PREP STAR PI-480αは48サンプルで、チューブ供給ユニットを付けると192サンプルです。

試薬の費用

装置の値段を公式に出しているのはクラボウで、QuickGene-Auto12SIIの本体は3,500,000円（税抜）、GENE PREP STAR PI-480αは6,500,000円（税抜）⁠で⁠す⁠。ほかの機種は見積もりで、専用の試薬を使い続けることも多いので、1検体あたりの試薬代まで出してもらって比べます。

処理時間と置き場所

magLEADの処理時間は、約27分からです。
QuickGene-Auto12SIIの処理時間は、最短30分程度です。
Maxwell RSC 48の処理時間は、30〜70分です。
Maxwell RSCの質量は11kgで、机の上に置けます。
GENE PREP STAR PI-480αの質量は約240kgで、床に置きます。

買う前に確かめること

診断に使うなら、製造販売の届出があるかを確かめます。KingFisherの公式ページには研究用途にのみ使うと書かれています。
汚染を防ぐ仕組みを確かめます。UVランプ、専用レーン、液を分注しない方式など、機種ごとに違います。
試薬の使用期限と、検体の数がそろわないときの無駄を見ます。