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バイオ肥料のメーカー5社比較【2026年】

バイオ肥料は、生きた菌を含み、
根の養分の吸収や土づくりを助ける農業資材です。

ABOUT

バイオ肥料とは

バイオ肥料とは、作物の根にすみつくVA菌根菌や、根のまわりで増えるバチルス菌などを、生きたまま含む資材です。
苗の根に付けたり畑にすき込んだりして、根の張りと養分の吸収、残さの分解を助けます。

バイオ肥料は、育苗・定植のときに根へ付けるか、畑に混ぜて土をつくるかで種類が分かれ、
含まれる菌の種類・使う時期・10aあたりの使用量・値段の違いで比べて選びます。

特に、使う量と値段を公式に出しているのはリサール酵産のカルスNC-Rで、菌株の名前まで公表しているのは日本農薬のクロスバリューです。
VA菌根菌の資材は、アグロカネショウのDr.キンコンが株当りの使用量まで出しています。

※VA菌根菌資材の定めは農林水産省の告示、使い方と注意はアグロカネショウ・日本農薬・リサール酵産の公式の製品ページと使用方法の資料、価格は各社の公式の価格の記載による。

LIST

バイオ肥料の比較表

バイオ肥料の価格・相場公開価格(税込)

相場価格
3,388円2製品の中央値

※公開価格の無い製品(5製品・各社 要見積)は入れていません。条件(税込・税抜・単位)の違う公開価格も入れていません

バイオ肥料7製品の比較
製品・メーカー製品の特徴製品の強み使用用途・場所価格

育苗・定植で根に付ける菌

3製品
アグロ カネショウ株式会社Dr.キンコン製品の詳細を見るメーカー公式サイトagrokanesho.co.jp

政令指定のVA菌根菌を含む細粒の微生物土壌改良材です。苗の根に直接付けるか植穴に入れ、播種時は育苗土に混ぜて使います。

VA菌根菌が作物の根に共生し、作の最後まで根と一緒に働きます。定植時に株当り1〜4gを苗の根に付けるだけで、リン酸を効率よく作物へ届けます。

野菜の定植・仮植の苗の根、育苗土

要見積
日本農薬株式会社クロスバリュー製品の詳細を見るメーカー公式サイトnichino.co.jp

バチルス リケニフォルミスとバチルス ズブチリスの2種を含む微生物資材です。水でうすめて育苗箱や株元に灌注するか、苗の根を浸けて使います。

菌株まで公表した2種のバチルス菌が根圏で増え、根の分岐と根毛の発達を助けます。稲の育苗箱・野菜のセルトレイ・果樹の苗木まで、使い方を作物ごとに出しています。

稲の育苗箱、野菜・花きの育苗トレイと定植の株元、果樹の苗木

要見積
ねぎびとカンパニー株式会社育苗用超微生物製品の詳細を見るメーカー公式サイトtorachangyouza.shop

ねぎ農家の会社が自社で作る超微生物を、育苗用に固形分を除いて微粉にしたものです。育苗箱やセルトレーの培土に混ぜて使います。

育苗箱やセルトレーで使うために、粉状の超微生物から固形分をさらに除いた微粉です。培土に混ざりやすく、公式の通販で3,498円(税込)と値段も出ています。

ねぎなどの育苗箱・セルトレーの培土

3,498円税込・⁠通販

畑に混ぜる土づくり用

4製品
アグロ カネショウ株式会社分解ヘルパー(331)製品の詳細を見るメーカー公式サイトagrokanesho.co.jp

有機物を分解するバチルス菌を生きたまま含むペレットです。植物油かす・乾燥菌体・尿素・硫安・過石を合わせ、分解した残さを次の作の肥料にします。

生きたバチルス菌に、N3.0%・P3.0%・K1.0%の肥料成分を合わせたペレットです。機械でまけて粉が立ちにくく、10aに45〜60kgをまいてすき込みます。

稲わら・野菜の残さ、緑肥をすき込む畑

要見積
島本微生物工業株式会社土こうじ製品の詳細を見るメーカー公式サイトbym-kouso.jp

山土粘土に放線菌・糸状菌・細菌・酵母菌などの有用微生物を培養した資材です。圃場に散布して、土の中の微生物相を豊かにします。

放線菌の数が一般的な畑土の1千〜1万倍あり、圃場にまくと病原菌の活動を抑えます。これまで農家がバイムフードで自家作製していた土こうじを、完成品にしたものです。

土壌病害や連作障害が気になる畑

要見積
ねぎびとカンパニー株式会社超微生物(粉状)製品の詳細を見るメーカー公式サイトtorachangyouza.shop

廃菌床・米糠・竹粉・貝化石などを原料に、放線菌やバチルス属などの微生物を含む資材です。粉状と約4.8mmのペレットがあります。

1gに50億個、数千〜数万種類の微生物を含みます。廃菌床・米糠・竹粉・貝化石を原料にした資材で、公式の通販で15kg 3,278円(税込)と値段も出ています。

野菜の畑の土づくり、育苗の培土

3,278円税込・⁠通販
リサール酵産株式会社カルスNC-R製品の詳細を見るメーカー公式サイトresahl.co.jp

多種多様な微生物で作物残さや稲わらを分解する、粉と粒の資材です。籾殻・米ぬか・硫安と一緒に畑へすき込み、潅水して発酵させます。

10aに30kg(3袋)⁠で⁠済⁠み⁠、10aあたり粉タイプ20,790円と、値段まで公式に出しています。残さや稲わらを分解しながら、1〜3週間あけて次の作を植えられます。

作物残さ・稲わらをすき込む野菜・花卉・茶の畑

粉タイプ10kg 6,930円(税込)、粒タイプ10kg 8,250円(税込)
FEATURES

バイオ肥料の特長と選ぶときの注意

使うメリット・効果

  • 根の届かない所の養分と水を、菌が集めてくる

    VA菌根菌は根に共生して、根張りを良くし、養水分を吸える範囲を広げます。特にリン酸を効率よく作物に届け、乾燥や土壌障害に強い苗にします。

  • 残さを畑の中で分解して、次の作の肥料にする

    バチルス菌などの資材は、稲わらや野菜の残さを畑の中で分解します。分解した残さは次の作で肥料として使われ、土の団粒化も進みます。

  • 植えたばかりの根の立ち上がりを助ける

    クロスバリューは根圏で増え、根の分岐・根毛の発達・根系の拡大を助けます。定植直後の根を環境ストレスから守り、活着をそろえます。

化成肥料・菌の入らない資材に比べたメリット

  • 与えた肥料だけでなく、土にあるリン酸を根へ運ぶ

    化成肥料は入れた成分を効かせる資材ですが、VA菌根菌の資材は土壌のりん酸供給能の改善を用途とする政令指定の土壌改良資材です。土にあるリン酸を、菌が根へ運びます。

  • 根と一緒に生きて、作の最後まで働く

    菌の入らない資材は入れた分を使い切れば終わりですが、VA菌根菌は作物の根と共に生き、作の最終まで働きます。

選ぶときに注意すること

  1. 殺菌剤の土壌処理と重ねない

    菌の資材は生き物なので、殺菌剤で菌が弱ります。Dr.キンコンはベンレート・トップジンMの土壌処理を避け、クロスバリューはチウラムを含む農薬と混ぜず、ダコニール(TPN)⁠と⁠は3日以上あけます。防除の予定表と合わせて使う日を決めます。

    よくある失敗定植前の土壌処理の殺菌剤と同じ日に、菌の資材を植穴に入れてしまう。

  2. 土壌消毒のあとは、ガス抜きを終えてから

    土壌消毒の薬剤が土に残っていると、入れた菌まで死にます。Dr.キンコンも分解ヘルパーも、土壌消毒のあとはガス抜きを終えてから使うと決めています。

    よくある失敗消毒からの日数だけを見て、ガス抜きの前に菌の資材をまいてしまう。

  3. リン酸の多い畑、アブラナ科・アカザ科には菌根菌が効きにくい

    VA菌根菌はリン酸を根へ運ぶ菌なので、リン酸含有量の極端に高い土では効果が出ないことがあります。アブラナ科・アカザ科では効果が確認されていません。土壌診断のリン酸の値と作物を先に見て、菌根菌かバチルス菌かを選びます。

    よくある失敗キャベツやほうれんそうの畑に、菌根菌の資材を入れてしまう。

  4. すき込んだら、植えるまで日をあける

    菌が残さを分解している間は、土の中で発酵が進んでいます。カルスNC-Rはすき込んで潅水したあと1〜3週間あけ、夏は1週間程度で次に進めます。作付けの予定から、すき込む日を逆算します。

    よくある失敗すき込んだ翌日に定植して、発酵の途中の土に苗を植えてしまう。

  5. 冷暗所にしまい、開けたら使い切る

    中の菌は温度と湿気で弱ります。Dr.キンコンは冷暗所に保存し、開封後は残さず使い切ると書いています。使う時期に合わせて、使い切れる量だけを頼みます。

    よくある失敗使いかけの袋を夏のハウスに置いたまま、次の作まで残してしまう。

Q&A

バイオ肥料選びで、よくある疑問

購買担当の疑問バイオ肥料って10aあたりいくらかかる?

畑にすき込む土づくり用なら、リサール酵産のカルスNC-Rで10aあたり粉タイプ20,790円(税込)⁠で⁠す⁠。10aに30kg(3袋)を使い、1袋10kgが6,930円(税込)⁠で⁠す⁠。ねぎびとカンパニーの超微生物は15kgで3,278円(税込)と袋の値段を出しています。値段を出していないメーカーは見積もりを取る必要があり、作物・面積・使う時期を伝えると早く返ってきます。

設備担当の疑問菌根菌とバチルス菌の資材、どっちを選べばいい?

リン酸を根に届けたい野菜の苗なら菌根菌、根の立ち上がりと残さの分解を広く助けたいならバチルス菌です。VA菌根菌は根に共生して特にリン酸を効率よく作物へ届け、バチルス菌は根圏で増えて根の分岐を助けたり、残さを分解したりします。アブラナ科・アカザ科の畑なら、菌根菌でなくバチルス菌の資材から選びます。

設備担当の疑問VA菌根菌の資材はどんな作物に効く?

トマトやねぎなどの野菜類に使えて、アブラナ科・アカザ科では効果が確認されていません。VA菌根菌は根に共生する菌で、共生しにくい作物があるためです。リン酸含有量の極端に高い土でも効果が出ないことがあるので、土壌診断のリン酸の値を見てから使う畑を決めます。

工場長の疑問バイオ肥料と化成肥料はどう違う?

化成肥料は成分そのものを与え、バイオ肥料は菌の働きで根の吸収と土づくりを助けます。VA菌根菌の資材は、土壌のりん酸供給能の改善を用途とする政令指定の土壌改良資材です。化成肥料の代わりではないので、元肥はいつもどおり入れ、バイオ肥料は根や土の働きを上げるために足して使います。

設備担当の疑問育苗箱にはどれくらい使う?

Dr.キンコンなら1箱10〜20g、クロスバリューなら100〜200倍にうすめて1箱0.5〜1Lです。Dr.キンコンは粉を育苗土に混ぜ、クロスバリューは稲の緑化始期から移植当日までに灌注します。育苗土にまとめて混ぜるなら、Dr.キンコンは育苗土500Lに1〜5kgです。

設備担当の疑問土壌消毒のあとにバイオ肥料を使っていい?

使えますが、ガス抜きを終えてからです。土に薬剤が残っていると、入れた菌まで死ぬためです。Dr.キンコンは完全にガス抜きをした上で使うと書き、分解ヘルパーは土壌消毒の前か、ガス抜きのあとにまいてすき込みます。消毒で減った土の微生物を、菌の資材で戻せます。

設備担当の疑問殺菌剤と一緒に使っても大丈夫?

種類によって、混ぜられない殺菌剤があります。Dr.キンコンはベンレート・トップジンMの土壌処理を避け、クロスバリューはチウラムを含む農薬と混ぜず、ダコニール(TPN)⁠と⁠は3日以上あけます。防除の予定表を見て、殺菌剤の土壌処理と重ならない日に使います。

設備担当の疑問残さをすき込んだあと、どれくらいで植えられる?

カルスNC-Rなら、すき込んで潅水してから1〜3週間です。菌が残さを分解して発酵が落ち着くまで待つためで、夏は1週間程度で次に進めます。作付けの日から逆算して、残さをすき込む日を決めます。すき込みの前に、籾殻・米ぬか・硫安を準備しておきます。

施設管理の疑問バイオ肥料はどう保管すればいい?

冷暗所にしまい、開けたら早めに使い切ります。中の菌は温度と湿気で弱るためです。Dr.キンコンは開封後に残さず使い切ると書き、カルスNC-Rの有効期限は開封前2年、開封後約6か月です。使う時期に合わせて、使い切れる量だけを頼みます。

経営者の疑問有機JASの栽培で使えるバイオ肥料は?

カルスNC-Rは有機JAS適合資材として認証済みです。ほかの製品は公式の製品ページに有機JASの記載が無いので、使う前にメーカーへ確かめる必要があります。認証機関に出す資材の一覧に載せるため、製品名と荷姿をそろえて問い合わせます。

総務の疑問値段が載っていないメーカーは、何を伝えて見積もりを取ればいい?

作物・面積(10aあたり)⁠・使う時期・育苗箱や株の数の4つを伝えます。アグロカネショウのDr.キンコンと分解ヘルパー、日本農薬のクロスバリュー、島本微生物工業の土こうじは値段を公式に出していないため、見積もりを取る必要があります。使用量が株当り・1箱当たり・10aあたりで決まるので、この数で必要な袋の数が出ます。

TYPES

バイオ肥料のバイオ肥料の種類の違い

育苗・定植で根に付ける菌

苗の根や育苗の培土に、菌根菌やバチルス菌を直接付けて使う資材です。

向いている使い方

  • 野菜の定植・仮植のとき
  • 稲や野菜の育苗箱
  • 果樹の苗木を植えるとき

根拠:本資材が作物の根に直接触れるよう処理する(出典2)

このバイオ肥料の種類の3製品を表で見る

畑に混ぜる土づくり用

畑にまいてすき込み、残さを分解しながら土の微生物を増やす資材です。

向いている使い方

  • 収穫後に残さをすき込むとき
  • 連作障害が気になる畑
  • 土壌消毒のあとの畑

根拠:有機物分解能力を持つバチルス菌を生きたままの状態で含んだ資材です(出典3)

このバイオ肥料の種類の4製品を表で見る
MAKERS

バイオ肥料の主なメーカー5社

アグロ カネショウ株式会社

特徴
農薬の製造・販売を行う会社です。
強み
  • 使う技術まで売る
  • 土壌を分析する

東京都

島本微生物工業株式会社

特徴
滋賀県甲賀市に本社を置き、微生物農法の資材を作る会社。
強み
  • 昭和21年から微生物農法の研究
  • 大学と共同研究

滋賀県

日本農薬株式会社

特徴
1928年の創業以来、農薬をコア技術として、医薬品、動物用医薬品、生活環境改善関連製品の製造販売に取り組む会社です。

東京都

ねぎびとカンパニー株式会社

特徴
ねぎの生産技術・苗の生産技術・農業の経営に特化した会社です。

山形県

リサール酵産株式会社

特徴
1986年5月20日設立。 生物系土壌改良資材と発酵促進資材を製造販売する会社。
強み
  • ギネス世界記録を達成
  • 土づくりの動画を毎日更新

埼玉県

出典
  1. アグロカネショウ Dr.キンコン 製品情報
  2. アグロカネショウ Dr.キンコン 使用方法(PDF)
  3. アグロカネショウ 分解ヘルパー(331) 製品情報
  4. アグロカネショウ 分解ヘルパー(331) 使用方法(PDF)
  5. 日本農薬 クロスバリュー特設ページ
  6. ねぎびとカンパニー 超微生物【粉状】
  7. ねぎびとカンパニー 育苗用超微生物
  8. リサール酵産 カルスNC-R 10kg
  9. 島本微生物工業 農業資材(土こうじ)
  10. 農林水産省 地力増進法の土壌改良資材の指定と表示の基準
  11. 出光興産 Dr.キンコン(資料)
掲載基準

農業生産で、作物の根の張りと養分の吸収、残さの分解と土づくりを助けるために使う、生きた菌(VA菌根菌・バチルス菌・放線菌など)を含む資材で、日本の会社が自社で作るか自社グループの製品として売り、公式サイトで今案内している製品です。各社の代表の品を1社1〜2製品、品名の単位で載せています。アグロカネショウのDr.キンコンは、出光興産のグループ会社として同社が販売しています。菌を含まない活性化液(ハイポネックスジャパンのマイコエナジーなど)、植物抽出物・アミノ酸や、葉から入る窒素固定菌(バイオスティミュラントの比較 biostimulant⁠)⁠、堆肥の山を発酵させる資材(発酵促進剤の比較 fermentation-accelerator)、土の物理性を直す土壌改良剤(soil-conditioner⁠)⁠、粒の化成肥料(kasei-hiryou)、病害虫を防ぐ微生物の農薬、家庭園芸向けの小容量だけの品は載せていません。島貿易のRootellaはイスラエルのGroundwork社の輸入品のため、白崎コーポレーションの客土パックVA-200とカクタニのVA菌根菌資材は公式サイトに製品ページを見つけられなかったため、EM研究機構のEM・1は販売ページの中身を取得できず仕様を確かめられなかったため、白崎コーポレーションの活力菌んぐは池・花壇向けのため、東海バイオは堆肥化の受託のため、載せていません。

バイオ肥料を作っているメーカーの方へ:掲載・訂正のご依頼(掲載は無料です)

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